Universidad de Talca

Browsing by Author "Arenas Salinas, Mauricio Antonio"

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    Thumbnail ImageTesis
    Diseño de compuestos multiblanco basado en similitudes de sitios de unión entre las estructuras de SERT y EAAT3 como potencial alternativa farmacológica para el tratamiento del Trastorno Obsesivo Compulsivo
    Autores: Letelier Sepúlveda, Luis Alfredo
    Profesor Guía: Núñez Vivanco, Gabriel armando
    Profesor Informante: Arenas Salinas, Mauricio Antonio
    A nivel mundial, se estima que el Trastorno Obsesivo Compulsivo (TOC) tiene una prevalencia en la población que varía del 2 a 3%, es un trastorno de carácter invalidante que se caracteriza por comportamientos repetitivos que invaden la conducta y la calidad de vida de las personas. Su etiología no está del todo clara, algunos modelos evidencian alteraciones en los circuitos frontoestriatales cerebrales, aun así, se indica que los componentes ambientales y genéticos serían su principal causa. En ese sentido, el TOC estaría influenciado por genes que modulan los sistemas serotoninérgico y glutamatérgico. En el sistema glutamatérgico, se ha demostrado que la transmisión excitatoria anormal en el SNC, vinculada a la función del transportador de glutamato EAAT3, sería un factor promotor de la enfermedad. En cuanto a, el sistema serotoninérgico bajos niveles de serotonina 5-HT han demostrado una sobreexcitación neuronal en zonas del cerebro ocurrentes de TOC. Hoy, los ISRS son el tratamiento de primera línea para la enfermedad, aún cuando su desarrollo farmacéutico es para la depresión mayor, estas drogas actúan bloqueando a SERT en el espacio sináptico, asimismo como compuestos que modulan el glutamato. El tratamiento farmacológico combinado con la psicoterapia han sido útiles para mantener a raya los síntomas, sin embargo estos reaparecen en casi la mitad de los pacientes, por lo cual se aprecia la necesidad urgente de un tratamiento farmacológico para TOC. La mayoría de los fármacos son desarrollados bajo el paradigma de “bala mágica”, que implica un diseño de compuestos altamente selectivos, pero en la práctica las drogas son naturalmente promiscuas y trastornos como el TOC son cuadros complejos que a menudo incluyen una amplia gama de objetivos, he ahí el perfil polifarmacológico. Las estructuras de SERT y EAAT3 humanas se utilizaron como blanco polifarmacológico, por ello, estas se equilibraron mediante simulaciones de DM, se determinaron 4 receptoforos mediante la búsqueda y descubrimiento de patrones comunes con la herramienta Geomfinder, se construyó una librería de compuestos a través de un modelo heurístico de algoritmo genético usando LEA3D para cada receptoforo. Travoprost, Ticagrelor, NRX-1074 y Rapastinel fueron los 4 compuestos seleccionados y sometidos a simulaciones de acoplamiento molecular en ambas estructuras en la suite Schrodinger Maestro. Travoprost, siendo una solución oftalmológica para el glaucoma presenta interacciones de tipo enlaces de hidrógeno en los residuos de Asp y Arg tanto en EAAT3 como SERT con puntajes de acoplamiento de -7.362 y -8.062 kcal/mol, respectivamente.
    Trastorno Obsesivo Compulsivo (TOC) Universidad de Talca (Chile). Escuela de Ingeniería Civil en Bioinformática. 2021
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    Thumbnail ImageArtículo de Revista
    Distribution of papA and papG Variants among Escherichia coli Genotypes: Association with Major Extraintestinal Pathogenic Lineages
    Autores: Fernández Yáñez, Valentina; Suazo, Patricio; Hormazábal, Claudia; Ibaceta, Valentina; Arenas Salinas, Mauricio Antonio; Vidal, Roberto M.; Silva Ojeda, Francisco; Arellano, Carolina; Muñoz, Ignacio; Del Canto, Felipe
    The pyelonephritis-associated fimbria (P fimbria) is one of the most recognized adhesion determinants of extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains (ExPECs). Twelve variants have been described for the gene encoding the P fimbria major structural subunit PapA and three variants for the gene encoding the adhesin subunit PapG. However, their distribution among the ExPEC diversity has not been comprehensively addressed. A complete landscape of that distribution might be valuable for delineating basic studies about the pathogenicity mechanisms of ExPECs and following up on the evolution of ExPEC lineages, particularly those most epidemiologically relevant. Therefore, we performed a massive descriptive study to detect the papA and papG variants along different E. coli genotypes represented by genomic sequences contained in the NCBI Assembly Refseq database. The most common papA variants were F11, F10, F48, F16, F12, and F7-2, which were found in significant association with the most relevant ExPEC genotypes, the phylogroups B2 and D, and the sequence types ST95, ST131, ST127, ST69, ST12, and ST73. On the other hand, the papGII variant was by far the most common followed by papGIII, and both were also found to have a significant association with common ExPEC genotypes. We noticed the presence of genomes, mainly belonging to the sequence type ST12, harboring two or three papA variants and two papG variants. Furthermore, the most common papA and papG variants were also detected in records representing strains isolated from humans and animals such as poultry, bovine, and dogs, supporting previous hypotheses of potential cross-transmission. Finally, we characterized a set of 17 genomes from Chilean uropathogenic E. coli strains and found that ST12 and ST73 were the predominant sequence types. Variants F7-1, F7-2, F8, F9, F11, F13, F14, F16, and F48 were detected for papA, and papGII and papGIII variants were detected for papG. Significant associations with the sequence types observed in the analysis of genomes contained in the NCBI Assembly Refseq database were also found in this collection in 16 of 19 cases for papA variants and 7 of 9 cases for the papG variants. This comprehensive characterization might support future basic studies about P fimbria-mediated ExPEC adherence and future typing or epidemiological studies to monitor the evolution of ExPECs producing P fimbria.
    P fimbria Mdpi 2024